Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc12Q8R344 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms