Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim29Q8R2Q0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim29Q8R2Q0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms