Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MyripQ8K3I4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms