Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Abcf3Q8K268 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms