Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sde2Q8K1J5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms