Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cldn34c1Q8K193 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cldn34c1Q8K193 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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