Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FgbQ8K0E8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms