Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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SbsnQ8CIT9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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SbsnQ8CIT9 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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