Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm28Q8CGC6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm28Q8CGC6 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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