Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Cdc34Q8CFI2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdc34Q8CFI2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms