Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E4f1Q8CCE9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E4f1Q8CCE9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms