Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Aph1bQ8C7N7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Aph1bQ8C7N7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Aph1bQ8C7N7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Aph1bQ8C7N7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Aph1bQ8C7N7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Aph1bQ8C7N7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Aph1bQ8C7N7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Aph1bQ8C7N7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aph1bQ8C7N7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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