Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfrp1Q8C4U3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms