Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms