Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1C8

Pnma1, Paraneoplastic antigen Ma1 homolog, mousemouse

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma1Q8C1C8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Pnma1Q8C1C8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pnma1Q8C1C8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pnma1Q8C1C8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pnma1Q8C1C8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pnma1Q8C1C8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pnma1Q8C1C8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pnma1Q8C1C8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pnma1Q8C1C8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pnma1Q8C1C8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pnma1Q8C1C8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pnma1Q8C1C8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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