Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms