Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca8Q8BHX3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca8Q8BHX3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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