Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms