Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms