Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cracr2bQ80ZJ8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms