Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Npm2Q80W85 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
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Npm2Q80W85 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Npm2Q80W85 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Npm2Q80W85 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Npm2Q80W85 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Npm2Q80W85 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Npm2Q80W85 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Npm2Q80W85 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Npm2Q80W85 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Npm2Q80W85 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Npm2Q80W85 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Npm2Q80W85 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Npm2Q80W85 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Npm2Q80W85 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Npm2Q80W85 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Npm2Q80W85 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Npm2Q80W85 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Npm2Q80W85 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Npm2Q80W85 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Npm2Q80W85 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Npm2Q80W85 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Npm2Q80W85 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Npm2Q80W85 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Npm2Q80W85 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Npm2Q80W85 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Npm2Q80W85 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Npm2Q80W85 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms