Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms