Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shq1Q7TMX5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
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Shq1Q7TMX5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Shq1Q7TMX5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Shq1Q7TMX5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Shq1Q7TMX5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Shq1Q7TMX5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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