Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Scn4bQ7M729 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Scn4bQ7M729 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Scn4bQ7M729 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Scn4bQ7M729 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scn4bQ7M729 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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