Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trappc6aQ78XR0 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc6aQ78XR0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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