Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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