Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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