Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trak1Q6PD31 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms