Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms