Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Senp6Q6P7W0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms