Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp12Q6P5B0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms