Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarca2Q6DIC0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms