Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms