Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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