Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sh3rf1Q69ZI1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sh3rf1Q69ZI1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3rf1Q69ZI1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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