Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg9aQ68FE2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms