Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2bQ64511 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2bQ64511 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2bQ64511 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2bQ64511 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2bQ64511 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2bQ64511 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms