Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja3Q64448 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja3Q64448 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms