Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Ccdc18Q640L5 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Ccdc18Q640L5 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Ccdc18Q640L5 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Ccdc18Q640L5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Ccdc18Q640L5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Ccdc18Q640L5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Ccdc18Q640L5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Ccdc18Q640L5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Ccdc18Q640L5 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms