Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Col4a5Q63ZW6 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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