Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms