Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms