Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ifi47Q61635 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ifi47Q61635 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ifi47Q61635 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifi47Q61635 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms