Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

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Length 824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ift88Q61371 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ift88Q61371 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ift88Q61371 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ift88Q61371 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ift88Q61371 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ift88Q61371 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ift88Q61371 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift88Q61371 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift88Q61371 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ift88Q61371 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift88Q61371 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift88Q61371 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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