Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Foxd1Q61345 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Foxd1Q61345 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Foxd1Q61345 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Foxd1Q61345 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms