Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Klf3Q60980 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms