Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms