Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cnot7Q60809 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cnot7Q60809 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cnot7Q60809 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cnot7Q60809 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cnot7Q60809 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cnot7Q60809 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cnot7Q60809 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cnot7Q60809 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cnot7Q60809 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cnot7Q60809 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cnot7Q60809 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cnot7Q60809 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cnot7Q60809 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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