Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms