Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rnf123Q5XPI3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rnf123Q5XPI3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rnf123Q5XPI3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rnf123Q5XPI3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rnf123Q5XPI3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rnf123Q5XPI3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rnf123Q5XPI3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rnf123Q5XPI3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rnf123Q5XPI3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rnf123Q5XPI3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rnf123Q5XPI3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rnf123Q5XPI3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rnf123Q5XPI3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rnf123Q5XPI3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rnf123Q5XPI3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rnf123Q5XPI3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rnf123Q5XPI3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rnf123Q5XPI3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf123Q5XPI3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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